Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01560Q8TB33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01560Q8TB33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01560Q8TB33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01560Q8TB33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC01560Q8TB33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms