Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PJA1Q8NG27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PJA1Q8NG27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PJA1Q8NG27 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA1Q8NG27 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA1Q8NG27 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms