Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBEAQ8NFP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NBEAQ8NFP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NBEAQ8NFP9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBEAQ8NFP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBEAQ8NFP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAQ8NFP9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBEAQ8NFP9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms