Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC24A4Q8NFF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A4Q8NFF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A4Q8NFF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A4Q8NFF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms