Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIK3C3Q8NEB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIK3C3Q8NEB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3C3Q8NEB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C3Q8NEB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms