Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNNM3Q8NE01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNNM3Q8NE01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNNM3Q8NE01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNNM3Q8NE01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNNM3Q8NE01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNNM3Q8NE01 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms