Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSD4Q8NDX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSD4Q8NDX1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSD4Q8NDX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD4Q8NDX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSD4Q8NDX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD4Q8NDX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD4Q8NDX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD4Q8NDX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD4Q8NDX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms