Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF248Q8NDW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF248Q8NDW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF248Q8NDW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF248Q8NDW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF248Q8NDW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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