Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
TDRD9Q8NDG6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
TDRD9Q8NDG6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
TDRD9Q8NDG6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
TDRD9Q8NDG6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TDRD9Q8NDG6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
TDRD9Q8NDG6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
TDRD9Q8NDG6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
TDRD9Q8NDG6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
TDRD9Q8NDG6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms