Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF1Q8ND25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF1Q8ND25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNRF1Q8ND25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNRF1Q8ND25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNRF1Q8ND25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms