Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPC24Q8NBT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPC24Q8NBT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SPC24Q8NBT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPC24Q8NBT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPC24Q8NBT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms