Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL23Q8NBE8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHL23Q8NBE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHL23Q8NBE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL23Q8NBE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL23Q8NBE8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHL23Q8NBE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL23Q8NBE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms