Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC29Q8NA56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC29Q8NA56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC29Q8NA56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC29Q8NA56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC29Q8NA56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.8 ms