Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD2AQ8NA29 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MFSD2AQ8NA29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD2AQ8NA29 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MFSD2AQ8NA29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms