Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD53Q8N9V6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD53Q8N9V6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD53Q8N9V6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms