Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DTX3Q8N9I9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DTX3Q8N9I9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DTX3Q8N9I9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX3Q8N9I9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DTX3Q8N9I9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX3Q8N9I9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms