Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM99Q8N816 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM99Q8N816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM99Q8N816 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM99Q8N816 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM99Q8N816 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM99Q8N816 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms