Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U6

EFHB, EF-hand domain-containing family member B, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHBQ8N7U6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EFHBQ8N7U6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EFHBQ8N7U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EFHBQ8N7U6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EFHBQ8N7U6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
EFHBQ8N7U6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFHBQ8N7U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms