Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDCL2Q8N4E4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDCL2Q8N4E4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDCL2Q8N4E4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDCL2Q8N4E4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.5 ms