Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PELI3Q8N2H9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PELI3Q8N2H9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PELI3Q8N2H9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PELI3Q8N2H9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PELI3Q8N2H9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PELI3Q8N2H9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PELI3Q8N2H9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PELI3Q8N2H9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PELI3Q8N2H9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms