Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC116Q8IYX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC116Q8IYX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC116Q8IYX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC116Q8IYX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC116Q8IYX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms