Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM2Q8IXS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM2Q8IXS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM2Q8IXS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALM2Q8IXS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2Q8IXS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PALM2Q8IXS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PALM2Q8IXS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms