Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC117Q8IWD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC117Q8IWD4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC117Q8IWD4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC117Q8IWD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC117Q8IWD4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms