Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
PBRM1Q86U86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PBRM1Q86U86 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
PBRM1Q86U86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
PBRM1Q86U86 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PBRM1Q86U86 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
PBRM1Q86U86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
PBRM1Q86U86 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
PBRM1Q86U86 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
PBRM1Q86U86 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PBRM1Q86U86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms