Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMED4Q7Z7H5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED4Q7Z7H5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMED4Q7Z7H5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED4Q7Z7H5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms