Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRC3Q7RTR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC3Q7RTR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC3Q7RTR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRC3Q7RTR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms