Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDPD3Q7L5L3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDPD3Q7L5L3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDPD3Q7L5L3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDPD3Q7L5L3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD3Q7L5L3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDPD3Q7L5L3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms