Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
HECW1Q76N89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
HECW1Q76N89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
HECW1Q76N89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HECW1Q76N89 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
HECW1Q76N89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
HECW1Q76N89 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
HECW1Q76N89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
HECW1Q76N89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HECW1Q76N89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
HECW1Q76N89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms