Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHSY3Q70JA7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHSY3Q70JA7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY3Q70JA7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY3Q70JA7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHSY3Q70JA7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms