Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DENND5BQ6ZUT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DENND5BQ6ZUT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DENND5BQ6ZUT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND5BQ6ZUT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms