Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM44Q6ZP01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM44Q6ZP01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBM44Q6ZP01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM44Q6ZP01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM44Q6ZP01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms