Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP26C1Q6V0L0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP26C1Q6V0L0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP26C1Q6V0L0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP26C1Q6V0L0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP26C1Q6V0L0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms