Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEACAM20Q6UY09 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEACAM20Q6UY09 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEACAM20Q6UY09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEACAM20Q6UY09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms