Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP12Q6UXS9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP12Q6UXS9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CASP12Q6UXS9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP12Q6UXS9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms