Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRAIDQ6UW56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATRAIDQ6UW56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATRAIDQ6UW56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATRAIDQ6UW56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATRAIDQ6UW56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms