Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL17Q6TDP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL17Q6TDP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL17Q6TDP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL17Q6TDP4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms