Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LARP1Q6PKG0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LARP1Q6PKG0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
LARP1Q6PKG0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LARP1Q6PKG0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LARP1Q6PKG0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LARP1Q6PKG0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
LARP1Q6PKG0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LARP1Q6PKG0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LARP1Q6PKG0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LARP1Q6PKG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms