Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN4Q6PJG9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN4Q6PJG9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN4Q6PJG9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN4Q6PJG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN4Q6PJG9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms