Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP4Q6PIL6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP4Q6PIL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP4Q6PIL6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms