Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RGMBQ6NW40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RGMBQ6NW40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RGMBQ6NW40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGMBQ6NW40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGMBQ6NW40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RGMBQ6NW40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RGMBQ6NW40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RGMBQ6NW40 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms