Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TYW3Q6IPR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TYW3Q6IPR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TYW3Q6IPR3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TYW3Q6IPR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TYW3Q6IPR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms