Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT79Q5XKE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT79Q5XKE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT79Q5XKE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT79Q5XKE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT79Q5XKE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT79Q5XKE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms