Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGSNQ5TDP6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGSNQ5TDP6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGSNQ5TDP6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms