Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECTD3Q5T447 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECTD3Q5T447 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HECTD3Q5T447 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECTD3Q5T447 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HECTD3Q5T447 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HECTD3Q5T447 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms