Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAP47Q5SQN1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAP47Q5SQN1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP47Q5SQN1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP47Q5SQN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP47Q5SQN1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNAP47Q5SQN1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms