Protein–RNA interactions for Protein: Q5RI15

COX20, Cytochrome c oxidase protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX20Q5RI15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COX20Q5RI15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COX20Q5RI15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX20Q5RI15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX20Q5RI15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COX20Q5RI15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms