Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC4Q5J8M3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMC4Q5J8M3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMC4Q5J8M3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMC4Q5J8M3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMC4Q5J8M3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms