Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf48Q5BLP8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf48Q5BLP8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf48Q5BLP8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf48Q5BLP8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms