Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB6CQ53S08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB6CQ53S08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB6CQ53S08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB6CQ53S08 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB6CQ53S08 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB6CQ53S08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms