Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00483Q53H64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00483Q53H64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00483Q53H64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00483Q53H64 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms